A bioinformatika hatalmas biológiai információ tárolásának, az ebben való keresésnek és elemzésnek a tudománya. Az emberi genomban 3 milliárd nukleotid található, nehéz lenne ezek szekvenciáit követni, elemezni egyszerű megfigyeléssel.Ugyanakkor a szekvenciák megismerése még csak a kezdet, hiszen további feldolgozást igényel ezek funkciója, a gének szerepe, kapcsolatuk betegségekkel. A bioinformatika két alapvető információ feldolgozást kínál: információtárolást adatbázisok formájában, valamint információ feldolgozási eszközöket, amelyekkel érdekes műveleteket, pl. összehasonlítás alapú kereséseket tesznek lehetővé.
A három napos bioinformatika foglalkozás során a diákok izelítőt kaptak az adatbázisok kezeléséről és az ezekből való információszerzés lehetőségéről.
Első na
p a 
szerkezeti genomika aktuális kérdéseit beszéltük meg, géneket kerestünk, ezek alapján pedig molekuláris evolúciós törzsfát állítottunk fel a főemlősök között a www.geneious.org adatbázis segítségével, majd az ember sajátos génállományát jelző SNPs-eket (single nucleotid polimorphism) kerestük fel a www.ensembl.org adatbázis segítségével és ezeket kapcsoltuk betegségekkel vagy betegségre való hajlammal.
Második nap gyakorlati feladatokat oldottunk meg a bűnüldözés témakörében a www.ncbi.org , a www.rcbs.org valamint a www.genames adatbázisok felkeresésével.
Harmadik nap egy feltételezett gyilkosság bűnősét kellett a diákoknak megtalálni gyakorlati feladatok formájában: vércsoport meghatározás, talajminta vizsgálat, PCR elektroforézis értelmezés, színanyagok kromatográfiás szétválasztásának segítségével.
József Éva – főszervező
Comments are closed.